home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00492 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.3 KB  |  31 lines
  1. **********************************
  2. * Myelin basic protein signature *
  3. **********************************
  4.  
  5. Myelin basic protein (MBP) [1,2] is an important hydrophilic protein which may
  6. function to maintain proper structure of myelin.  MBP  interacts  with  myelin
  7. lipids both electrostatically and by hydrophobic interactions.
  8.  
  9. In mammals various forms of  MBP exist which  are  produced by the alternative
  10. splicing of a single gene; these forms  differ  by the presence or the absence
  11. of short (10 to 20 residues)  peptides  in  various  internal locations in the
  12. sequence.  The  major form of MBP is generally a protein of about 18.5 Kd (170
  13. residues).
  14.  
  15. MBP is the target of many post-translational modifications: it is N-terminally
  16. acetylated,  methylated  on  an  arginine residue, phosphorylated  by  various
  17. serine/threonine protein-kinases, and deamidated on some glutamine residues.
  18.  
  19. As a signature  pattern  for MBP we selected  the  best  conserved part of the
  20. protein, a perfectly conserved heptapeptide.
  21.  
  22. -Consensus pattern: V-V-H-F-F-K-N
  23. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  24. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  25. -Last update: December 1991 / First entry.
  26.  
  27. [ 1] Deber C.M., Reynolds S.J.
  28.      Clin. Biochem. 24:113-134(1991).
  29. [ 2] Inouye H., Kirschner D.A.
  30.      J. Neurosci. Res. 28:1-17(1991).
  31.